Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc174Q3U155 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc174Q3U155 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms