Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hace1Q3U0D9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms