Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc1Q0VDN7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms