Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms