Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MitfQ08874 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MitfQ08874 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms