Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms