Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cntn3Q07409 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cntn3Q07409 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cntn3Q07409 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cntn3Q07409 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cntn3Q07409 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cntn3Q07409 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cntn3Q07409 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cntn3Q07409 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cntn3Q07409 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cntn3Q07409 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cntn3Q07409 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cntn3Q07409 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cntn3Q07409 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cntn3Q07409 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cntn3Q07409 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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