Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPINDOCQ05AH6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms