Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sox13Q04891 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox13Q04891 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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