Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Col6a1Q04857 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms