Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GscQ02591 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GscQ02591 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms