Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms