Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin2bQ01097 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2bQ01097 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms