Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms