Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms