Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms