Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms