Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited1P97769 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms