Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarbp2P97473 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms