Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf1bP97358 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms