Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmsP97355 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SmsP97355 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SmsP97355 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms