Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ErfP70459 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ErfP70459 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ErfP70459 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ErfP70459 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ErfP70459 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms