Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rps29P62274 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms