Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms