Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ufm1P61961 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufm1P61961 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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