Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csrnp3P59055 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Csrnp3P59055 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms