Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd4P58467 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms