Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpa1P57784 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpa1P57784 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms