Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Cldn18P56857 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cldn18P56857 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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