Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms