Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms