Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms