Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TspoP50637 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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