Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SftpdP50404 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms