Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VdrP48281 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VdrP48281 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
VdrP48281 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VdrP48281 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VdrP48281 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VdrP48281 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
VdrP48281 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VdrP48281 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VdrP48281 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms