Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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