Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cap1P40124 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms