Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Timp3P39876 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Timp3P39876 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms