Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms