Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2aP35436 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms