Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd3P30282 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms