Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BgnP28653 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BgnP28653 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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