Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa3P28310 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms