Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms