Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NdnP25233 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NdnP25233 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NdnP25233 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NdnP25233 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NdnP25233 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NdnP25233 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NdnP25233 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NdnP25233 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NdnP25233 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NdnP25233 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NdnP25233 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NdnP25233 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NdnP25233 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NdnP25233 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms