Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PparaP23204 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PparaP23204 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PparaP23204 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms