Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RarbP22605 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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