Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms