Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pou5f1P20263 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms