Protein–RNA interactions for Protein: P19788

Mgp, Matrix Gla protein, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MgpP19788 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MgpP19788 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MgpP19788 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MgpP19788 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms